Ударно-хвильова терапія може мати певні побічні ефекти. Ударно-хвильова терапія зазвичай використовує сильні повітряні хвилі для досягнення терапевтичного ефекту. У процесі лікування це може призвести до пошкодження нирок, вторинних каменів у сечоводі та розширення сечоводу. Деякі пацієнти також можуть відчувати місцеве почервоніння тканин, підшкірну кровотечу, синці, біль та інші симптоми. Але переважна більшість випадків є тимчасовими й поступово покращується після 1-2 днів лікування. Пацієнтам рекомендується не хвилюватися, дотримуватися призначень лікаря, вчасно лікуватися і контролювати свій стан.